Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC11A1P49279 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC11A1P49279 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms