Protein–RNA interactions for Protein: P48304

REG1B, Lithostathine-1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG1BP48304 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
REG1BP48304 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REG1BP48304 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
REG1BP48304 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
REG1BP48304 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REG1BP48304 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
REG1BP48304 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REG1BP48304 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
REG1BP48304 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REG1BP48304 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REG1BP48304 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REG1BP48304 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REG1BP48304 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REG1BP48304 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REG1BP48304 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
REG1BP48304 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REG1BP48304 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
REG1BP48304 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REG1BP48304 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
REG1BP48304 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
REG1BP48304 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REG1BP48304 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
REG1BP48304 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REG1BP48304 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
REG1BP48304 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
REG1BP48304 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REG1BP48304 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REG1BP48304 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
REG1BP48304 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REG1BP48304 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
REG1BP48304 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
REG1BP48304 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REG1BP48304 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REG1BP48304 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
REG1BP48304 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REG1BP48304 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REG1BP48304 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
REG1BP48304 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REG1BP48304 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REG1BP48304 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
REG1BP48304 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REG1BP48304 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
REG1BP48304 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
REG1BP48304 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
REG1BP48304 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
REG1BP48304 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
REG1BP48304 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
REG1BP48304 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
REG1BP48304 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
REG1BP48304 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
REG1BP48304 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
REG1BP48304 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
REG1BP48304 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
REG1BP48304 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
REG1BP48304 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
REG1BP48304 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
REG1BP48304 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
REG1BP48304 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
REG1BP48304 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
REG1BP48304 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
REG1BP48304 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
REG1BP48304 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
REG1BP48304 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
REG1BP48304 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
REG1BP48304 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
REG1BP48304 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
REG1BP48304 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
REG1BP48304 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
REG1BP48304 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
REG1BP48304 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
REG1BP48304 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
REG1BP48304 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
REG1BP48304 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
REG1BP48304 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
REG1BP48304 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
REG1BP48304 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
REG1BP48304 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
REG1BP48304 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
REG1BP48304 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REG1BP48304 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
REG1BP48304 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REG1BP48304 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
REG1BP48304 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REG1BP48304 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REG1BP48304 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
REG1BP48304 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
REG1BP48304 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
REG1BP48304 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REG1BP48304 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REG1BP48304 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REG1BP48304 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
REG1BP48304 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REG1BP48304 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REG1BP48304 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
REG1BP48304 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REG1BP48304 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REG1BP48304 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
REG1BP48304 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
REG1BP48304 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REG1BP48304 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms