Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms