Protein–RNA interactions for Protein: P40080

VFA1, VPS4-associated protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1P40080 UBP2YOR124C 3819 nt2.27□□□□□ -2.05
VFA1P40080 YDR008CYDR008C 351 nt2.27□□□□□ -2.05
VFA1P40080 CSN9YDR179C 489 nt2.27□□□□□ -2.05
VFA1P40080 PRE4YFR050C 801 nt2.27□□□□□ -2.05
VFA1P40080 RPS17AYML024W 411 nt2.27□□□□□ -2.05
VFA1P40080 YBL083CYBL083C 426 nt2.27□□□□□ -2.05
VFA1P40080 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.27□□□□□ -2.05
VFA1P40080 EDS1YBR033W 2760 nt2.27□□□□□ -2.05
VFA1P40080 VMR1YHL035C 4779 nt2.27□□□□□ -2.05
VFA1P40080 SNF5YBR289W 2718 nt2.27□□□□□ -2.05
VFA1P40080 SET2YJL168C 2202 nt2.27□□□□□ -2.05
VFA1P40080 STE5YDR103W 2754 nt2.26□□□□□ -2.05
VFA1P40080 IRR1YIL026C 3453 nt2.26□□□□□ -2.05
VFA1P40080 snR65snR65 100 nt2.26□□□□□ -2.05
VFA1P40080 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt2.26□□□□□ -2.05
VFA1P40080 HOP2YGL033W 657 nt2.26□□□□□ -2.05
VFA1P40080 YIL059CYIL059C 366 nt2.26□□□□□ -2.05
VFA1P40080 NUP170YBL079W 4509 nt2.26□□□□□ -2.05
VFA1P40080 MNE1YOR350C 1992 nt2.25□□□□□ -2.05
VFA1P40080 OSH6YKR003W 1347 nt2.25□□□□□ -2.05
VFA1P40080 RPL35AYDL191W 363 nt2.25□□□□□ -2.05
VFA1P40080 HHT1YBR010W 411 nt2.25□□□□□ -2.05
VFA1P40080 PEX8YGR077C 1770 nt2.24□□□□□ -2.05
VFA1P40080 VPS8YAL002W 3825 nt2.24□□□□□ -2.05
VFA1P40080 TAR1YLR154W-C 375 nt2.24□□□□□ -2.05
VFA1P40080 SPP41YDR464W 4308 nt2.24□□□□□ -2.05
VFA1P40080 SLM1YIL105C 2061 nt2.23□□□□□ -2.05
VFA1P40080 YFL063WYFL063W 456 nt2.23□□□□□ -2.05
VFA1P40080 YHL041WYHL041W 450 nt2.23□□□□□ -2.05
VFA1P40080 ACM1YPL267W 630 nt2.23□□□□□ -2.05
VFA1P40080 ZRG8YER033C 3231 nt2.23□□□□□ -2.05
VFA1P40080 YDR239CYDR239C 2364 nt2.23□□□□□ -2.05
VFA1P40080 SIR3YLR442C 2937 nt2.23□□□□□ -2.05
VFA1P40080 YCR043CYCR043C 384 nt2.22□□□□□ -2.05
VFA1P40080 BRP1YGL007W 378 nt2.22□□□□□ -2.05
VFA1P40080 YNL114CYNL114C 372 nt2.22□□□□□ -2.05
VFA1P40080 MCD1YDL003W 1701 nt2.22□□□□□ -2.05
VFA1P40080 NEO1YIL048W 3456 nt2.22□□□□□ -2.05
VFA1P40080 YRB1YDR002W 606 nt2.21□□□□□ -2.06
VFA1P40080 VPS34YLR240W 2628 nt2.21□□□□□ -2.06
VFA1P40080 SAR1YPL218W 573 nt2.21□□□□□ -2.06
VFA1P40080 NOP14YDL148C 2433 nt2.21□□□□□ -2.06
VFA1P40080 VPH1YOR270C 2523 nt2.21□□□□□ -2.06
VFA1P40080 PSD2YGR170W 3417 nt2.2□□□□□ -2.06
VFA1P40080 TIM9YEL020W-A 264 nt2.2□□□□□ -2.06
VFA1P40080 RPL42BYHR141C 321 nt2.2□□□□□ -2.06
VFA1P40080 ATP7YKL016C 525 nt2.2□□□□□ -2.06
VFA1P40080 RPL42AYNL162W 321 nt2.2□□□□□ -2.06
VFA1P40080 RAV1YJR033C 4074 nt2.2□□□□□ -2.06
VFA1P40080 GRR1YJR090C 3456 nt2.19□□□□□ -2.06
VFA1P40080 YPR097WYPR097W 3222 nt2.19□□□□□ -2.06
VFA1P40080 SGM1YJR134C 2124 nt2.19□□□□□ -2.06
VFA1P40080 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.19□□□□□ -2.06
VFA1P40080 YAR029WYAR029W 225 nt2.19□□□□□ -2.06
VFA1P40080 RPL38YLR325C 237 nt2.19□□□□□ -2.06
VFA1P40080 HTB2YBL002W 396 nt2.19□□□□□ -2.06
VFA1P40080 NUT2YPR168W 474 nt2.19□□□□□ -2.06
VFA1P40080 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt2.18□□□□□ -2.06
VFA1P40080 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt2.18□□□□□ -2.06
VFA1P40080 IRA2YOL081W 9240 nt2.18□□□□□ -2.06
VFA1P40080 NOP53YPL146C 1368 nt2.18□□□□□ -2.06
VFA1P40080 RTT107YHR154W 3213 nt2.18□□□□□ -2.06
VFA1P40080 GIP3YPL137C 3831 nt2.18□□□□□ -2.06
VFA1P40080 RIM20YOR275C 1986 nt2.18□□□□□ -2.06
VFA1P40080 TRL1YJL087C 2484 nt2.17□□□□□ -2.06
VFA1P40080 PXA2YKL188C 2562 nt2.17□□□□□ -2.06
VFA1P40080 KOG1YHR186C 4674 nt2.17□□□□□ -2.06
VFA1P40080 YDL062WYDL062W 426 nt2.17□□□□□ -2.06
VFA1P40080 YFH1YDL120W 525 nt2.17□□□□□ -2.06
VFA1P40080 YLR053CYLR053C 327 nt2.17□□□□□ -2.06
VFA1P40080 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt2.17□□□□□ -2.06
VFA1P40080 EFR3YMR212C 2349 nt2.17□□□□□ -2.06
VFA1P40080 RPH1YER169W 2391 nt2.16□□□□□ -2.06
VFA1P40080 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.15□□□□□ -2.07
VFA1P40080 CYB5YNL111C 363 nt2.15□□□□□ -2.07
VFA1P40080 UBP1YDL122W 2430 nt2.15□□□□□ -2.07
VFA1P40080 HTL1YCR020W-B 237 nt2.14□□□□□ -2.07
VFA1P40080 MRP10YDL045W-A 288 nt2.14□□□□□ -2.07
VFA1P40080 YDL118WYDL118W 381 nt2.14□□□□□ -2.07
VFA1P40080 UPS1YLR193C 528 nt2.14□□□□□ -2.07
VFA1P40080 PHO2YDL106C 1680 nt2.14□□□□□ -2.07
VFA1P40080 YDR341CYDR341C 1824 nt2.13□□□□□ -2.07
VFA1P40080 HDA3YPR179C 1968 nt2.13□□□□□ -2.07
VFA1P40080 YCR022CYCR022C 345 nt2.13□□□□□ -2.07
VFA1P40080 YBL012CYBL012C 402 nt2.13□□□□□ -2.07
VFA1P40080 PLC1YPL268W 2610 nt2.13□□□□□ -2.07
VFA1P40080 SWI6YLR182W 2412 nt2.12□□□□□ -2.07
VFA1P40080 YDR048CYDR048C 315 nt2.12□□□□□ -2.07
VFA1P40080 CYC7YEL039C 342 nt2.12□□□□□ -2.07
VFA1P40080 YGL149WYGL149W 306 nt2.12□□□□□ -2.07
VFA1P40080 EMP24YGL200C 612 nt2.12□□□□□ -2.07
VFA1P40080 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.12□□□□□ -2.07
VFA1P40080 PAU18YLL064C 363 nt2.12□□□□□ -2.07
VFA1P40080 YML007C-AYML007C-A 111 nt2.12□□□□□ -2.07
VFA1P40080 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt2.12□□□□□ -2.07
VFA1P40080 PAU6YNR076W 363 nt2.12□□□□□ -2.07
VFA1P40080 SWI5YDR146C 2130 nt2.12□□□□□ -2.07
VFA1P40080 CDC60YPL160W 3273 nt2.12□□□□□ -2.07
VFA1P40080 SSQ1YLR369W 1974 nt2.12□□□□□ -2.07
VFA1P40080 GYP5YPL249C 2685 nt2.12□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.1 ms