Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms