Protein–RNA interactions for Protein: P33261

CYP2C19, Cytochrome P450 2C19, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C19P33261 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP2C19P33261 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP2C19P33261 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms