Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2H1P32780 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GTF2H1P32780 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2H1P32780 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2H1P32780 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2H1P32780 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2H1P32780 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2H1P32780 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2H1P32780 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2H1P32780 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2H1P32780 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2H1P32780 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms