Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 CBWD3-206ENST00000478048 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 AL138729.1-201ENST00000406666 664 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 AC010086.1-201ENST00000437359 1052 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 ZNF197-AS1-201ENST00000447691 623 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 AC009245.1-201ENST00000456481 862 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 AC078899.4-201ENST00000593952 1113 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 AL049840.6-202ENST00000603373 279 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 GBP1P1-201ENST00000394662 1740 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 AC011632.1-203ENST00000522914 454 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 C11orf65-203ENST00000525729 1263 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 AP001099.1-201ENST00000579385 855 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 AP005121.2-201ENST00000583306 1101 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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