Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms