Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms