Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXA10P31260 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms