Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPOP30536 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPOP30536 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPOP30536 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPOP30536 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPOP30536 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPOP30536 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPOP30536 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPOP30536 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPOP30536 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPOP30536 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPOP30536 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPOP30536 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPOP30536 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPOP30536 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPOP30536 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPOP30536 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPOP30536 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPOP30536 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPOP30536 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPOP30536 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPOP30536 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPOP30536 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPOP30536 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPOP30536 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPOP30536 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPOP30536 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPOP30536 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPOP30536 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPOP30536 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPOP30536 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPOP30536 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPOP30536 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPOP30536 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPOP30536 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPOP30536 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPOP30536 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPOP30536 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPOP30536 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPOP30536 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPOP30536 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPOP30536 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPOP30536 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPOP30536 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPOP30536 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPOP30536 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPOP30536 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPOP30536 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPOP30536 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPOP30536 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPOP30536 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPOP30536 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPOP30536 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPOP30536 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPOP30536 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPOP30536 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPOP30536 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPOP30536 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPOP30536 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPOP30536 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPOP30536 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPOP30536 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPOP30536 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPOP30536 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPOP30536 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPOP30536 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPOP30536 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPOP30536 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPOP30536 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPOP30536 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPOP30536 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPOP30536 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPOP30536 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPOP30536 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPOP30536 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPOP30536 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPOP30536 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPOP30536 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPOP30536 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPOP30536 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPOP30536 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPOP30536 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPOP30536 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPOP30536 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPOP30536 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPOP30536 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPOP30536 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPOP30536 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPOP30536 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPOP30536 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPOP30536 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPOP30536 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPOP30536 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPOP30536 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPOP30536 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPOP30536 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPOP30536 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPOP30536 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPOP30536 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPOP30536 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms