Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP5DP30049 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP5DP30049 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP5DP30049 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP5DP30049 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP5DP30049 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP5DP30049 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP5DP30049 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP5DP30049 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP5DP30049 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP5DP30049 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP5DP30049 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP5DP30049 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP5DP30049 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP5DP30049 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP5DP30049 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP5DP30049 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP5DP30049 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP5DP30049 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP5DP30049 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP5DP30049 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP5DP30049 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
ATP5DP30049 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP5DP30049 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms