Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms