Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms