Protein–RNA interactions for Protein: P27482

CALML3, Calmodulin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML3P27482 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALML3P27482 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CALML3P27482 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALML3P27482 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALML3P27482 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CALML3P27482 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALML3P27482 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALML3P27482 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALML3P27482 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALML3P27482 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALML3P27482 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALML3P27482 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALML3P27482 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALML3P27482 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALML3P27482 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALML3P27482 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALML3P27482 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALML3P27482 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALML3P27482 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALML3P27482 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALML3P27482 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALML3P27482 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALML3P27482 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALML3P27482 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALML3P27482 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALML3P27482 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALML3P27482 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CALML3P27482 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALML3P27482 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALML3P27482 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALML3P27482 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALML3P27482 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALML3P27482 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALML3P27482 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALML3P27482 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALML3P27482 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALML3P27482 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALML3P27482 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALML3P27482 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALML3P27482 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALML3P27482 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALML3P27482 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALML3P27482 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CALML3P27482 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALML3P27482 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALML3P27482 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALML3P27482 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALML3P27482 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CALML3P27482 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALML3P27482 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALML3P27482 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALML3P27482 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALML3P27482 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALML3P27482 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALML3P27482 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALML3P27482 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALML3P27482 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALML3P27482 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALML3P27482 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALML3P27482 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALML3P27482 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CALML3P27482 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALML3P27482 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALML3P27482 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALML3P27482 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALML3P27482 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALML3P27482 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CALML3P27482 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CALML3P27482 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CALML3P27482 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CALML3P27482 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CALML3P27482 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CALML3P27482 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALML3P27482 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALML3P27482 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALML3P27482 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALML3P27482 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALML3P27482 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALML3P27482 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CALML3P27482 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALML3P27482 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALML3P27482 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALML3P27482 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALML3P27482 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALML3P27482 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALML3P27482 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALML3P27482 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALML3P27482 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALML3P27482 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALML3P27482 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALML3P27482 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALML3P27482 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALML3P27482 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALML3P27482 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALML3P27482 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALML3P27482 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALML3P27482 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CALML3P27482 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALML3P27482 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALML3P27482 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms