Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO1P25800 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO1P25800 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO1P25800 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO1P25800 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO1P25800 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO1P25800 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO1P25800 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO1P25800 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO1P25800 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO1P25800 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO1P25800 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO1P25800 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO1P25800 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO1P25800 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO1P25800 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO1P25800 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO1P25800 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO1P25800 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO1P25800 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO1P25800 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO1P25800 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO1P25800 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO1P25800 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO1P25800 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO1P25800 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO1P25800 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO1P25800 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO1P25800 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO1P25800 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO1P25800 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO1P25800 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO1P25800 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO1P25800 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO1P25800 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO1P25800 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO1P25800 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO1P25800 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO1P25800 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO1P25800 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO1P25800 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO1P25800 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO1P25800 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO1P25800 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO1P25800 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO1P25800 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO1P25800 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO1P25800 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO1P25800 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO1P25800 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO1P25800 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO1P25800 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO1P25800 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO1P25800 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO1P25800 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMO1P25800 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMO1P25800 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMO1P25800 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMO1P25800 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMO1P25800 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LMO1P25800 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMO1P25800 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMO1P25800 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMO1P25800 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMO1P25800 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMO1P25800 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMO1P25800 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMO1P25800 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LMO1P25800 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMO1P25800 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMO1P25800 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMO1P25800 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMO1P25800 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMO1P25800 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMO1P25800 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMO1P25800 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMO1P25800 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LMO1P25800 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LMO1P25800 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LMO1P25800 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LMO1P25800 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LMO1P25800 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LMO1P25800 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LMO1P25800 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LMO1P25800 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMO1P25800 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMO1P25800 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMO1P25800 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMO1P25800 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMO1P25800 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMO1P25800 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMO1P25800 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMO1P25800 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMO1P25800 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMO1P25800 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMO1P25800 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMO1P25800 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LMO1P25800 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMO1P25800 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMO1P25800 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms