Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX1P22670 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX1P22670 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX1P22670 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX1P22670 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX1P22670 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX1P22670 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX1P22670 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX1P22670 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX1P22670 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX1P22670 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX1P22670 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX1P22670 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX1P22670 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX1P22670 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX1P22670 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX1P22670 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX1P22670 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX1P22670 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX1P22670 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX1P22670 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX1P22670 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX1P22670 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX1P22670 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX1P22670 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX1P22670 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX1P22670 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX1P22670 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX1P22670 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX1P22670 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX1P22670 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX1P22670 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX1P22670 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX1P22670 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX1P22670 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX1P22670 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX1P22670 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX1P22670 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX1P22670 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX1P22670 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX1P22670 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX1P22670 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX1P22670 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX1P22670 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX1P22670 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX1P22670 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX1P22670 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX1P22670 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX1P22670 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX1P22670 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX1P22670 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX1P22670 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX1P22670 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX1P22670 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX1P22670 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX1P22670 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX1P22670 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX1P22670 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX1P22670 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX1P22670 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX1P22670 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX1P22670 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX1P22670 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX1P22670 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX1P22670 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX1P22670 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX1P22670 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX1P22670 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX1P22670 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX1P22670 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX1P22670 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX1P22670 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX1P22670 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX1P22670 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX1P22670 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX1P22670 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX1P22670 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX1P22670 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX1P22670 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX1P22670 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX1P22670 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX1P22670 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX1P22670 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX1P22670 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX1P22670 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX1P22670 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX1P22670 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX1P22670 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX1P22670 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX1P22670 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX1P22670 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX1P22670 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX1P22670 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX1P22670 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX1P22670 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX1P22670 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX1P22670 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX1P22670 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX1P22670 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX1P22670 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms