Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCL3P20749 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCL3P20749 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCL3P20749 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCL3P20749 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCL3P20749 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCL3P20749 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCL3P20749 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCL3P20749 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCL3P20749 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCL3P20749 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCL3P20749 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCL3P20749 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCL3P20749 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BCL3P20749 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BCL3P20749 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCL3P20749 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BCL3P20749 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCL3P20749 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCL3P20749 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCL3P20749 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCL3P20749 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCL3P20749 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCL3P20749 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCL3P20749 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCL3P20749 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCL3P20749 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCL3P20749 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCL3P20749 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BCL3P20749 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BCL3P20749 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BCL3P20749 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BCL3P20749 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BCL3P20749 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BCL3P20749 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BCL3P20749 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BCL3P20749 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BCL3P20749 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BCL3P20749 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BCL3P20749 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BCL3P20749 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BCL3P20749 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BCL3P20749 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BCL3P20749 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BCL3P20749 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BCL3P20749 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BCL3P20749 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BCL3P20749 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BCL3P20749 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BCL3P20749 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BCL3P20749 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BCL3P20749 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BCL3P20749 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BCL3P20749 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BCL3P20749 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BCL3P20749 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BCL3P20749 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BCL3P20749 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BCL3P20749 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BCL3P20749 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BCL3P20749 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BCL3P20749 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BCL3P20749 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BCL3P20749 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BCL3P20749 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BCL3P20749 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BCL3P20749 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BCL3P20749 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BCL3P20749 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BCL3P20749 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BCL3P20749 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BCL3P20749 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BCL3P20749 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BCL3P20749 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BCL3P20749 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BCL3P20749 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BCL3P20749 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BCL3P20749 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BCL3P20749 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BCL3P20749 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BCL3P20749 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BCL3P20749 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BCL3P20749 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BCL3P20749 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BCL3P20749 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BCL3P20749 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BCL3P20749 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BCL3P20749 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BCL3P20749 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BCL3P20749 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BCL3P20749 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BCL3P20749 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BCL3P20749 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BCL3P20749 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BCL3P20749 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BCL3P20749 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BCL3P20749 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BCL3P20749 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BCL3P20749 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BCL3P20749 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms