Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PVALBP20472 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PVALBP20472 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PVALBP20472 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PVALBP20472 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PVALBP20472 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PVALBP20472 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PVALBP20472 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PVALBP20472 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PVALBP20472 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PVALBP20472 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PVALBP20472 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PVALBP20472 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PVALBP20472 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PVALBP20472 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PVALBP20472 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PVALBP20472 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PVALBP20472 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PVALBP20472 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PVALBP20472 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PVALBP20472 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PVALBP20472 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PVALBP20472 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PVALBP20472 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PVALBP20472 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PVALBP20472 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PVALBP20472 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PVALBP20472 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PVALBP20472 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PVALBP20472 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PVALBP20472 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PVALBP20472 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PVALBP20472 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PVALBP20472 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PVALBP20472 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PVALBP20472 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PVALBP20472 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PVALBP20472 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PVALBP20472 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PVALBP20472 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PVALBP20472 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PVALBP20472 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PVALBP20472 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PVALBP20472 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PVALBP20472 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PVALBP20472 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PVALBP20472 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PVALBP20472 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PVALBP20472 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PVALBP20472 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PVALBP20472 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PVALBP20472 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PVALBP20472 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PVALBP20472 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PVALBP20472 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PVALBP20472 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PVALBP20472 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PVALBP20472 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PVALBP20472 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PVALBP20472 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PVALBP20472 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PVALBP20472 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PVALBP20472 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PVALBP20472 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PVALBP20472 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PVALBP20472 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PVALBP20472 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PVALBP20472 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PVALBP20472 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PVALBP20472 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PVALBP20472 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PVALBP20472 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PVALBP20472 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PVALBP20472 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PVALBP20472 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PVALBP20472 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PVALBP20472 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PVALBP20472 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PVALBP20472 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PVALBP20472 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PVALBP20472 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PVALBP20472 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PVALBP20472 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PVALBP20472 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PVALBP20472 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PVALBP20472 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PVALBP20472 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PVALBP20472 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PVALBP20472 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PVALBP20472 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PVALBP20472 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PVALBP20472 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PVALBP20472 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PVALBP20472 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PVALBP20472 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PVALBP20472 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PVALBP20472 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PVALBP20472 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PVALBP20472 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PVALBP20472 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms