Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms