Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL17P18621 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL17P18621 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL17P18621 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL17P18621 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL17P18621 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL17P18621 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL17P18621 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL17P18621 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL17P18621 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL17P18621 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL17P18621 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL17P18621 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL17P18621 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL17P18621 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL17P18621 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL17P18621 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL17P18621 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL17P18621 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL17P18621 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL17P18621 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL17P18621 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL17P18621 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL17P18621 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL17P18621 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL17P18621 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL17P18621 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL17P18621 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL17P18621 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL17P18621 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL17P18621 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL17P18621 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL17P18621 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL17P18621 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL17P18621 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL17P18621 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL17P18621 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL17P18621 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL17P18621 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL17P18621 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL17P18621 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL17P18621 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL17P18621 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL17P18621 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL17P18621 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL17P18621 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL17P18621 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL17P18621 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL17P18621 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL17P18621 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL17P18621 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL17P18621 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL17P18621 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL17P18621 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL17P18621 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL17P18621 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL17P18621 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPL17P18621 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPL17P18621 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPL17P18621 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPL17P18621 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPL17P18621 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL17P18621 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL17P18621 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL17P18621 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL17P18621 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL17P18621 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL17P18621 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL17P18621 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL17P18621 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL17P18621 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL17P18621 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL17P18621 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL17P18621 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL17P18621 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL17P18621 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL17P18621 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL17P18621 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL17P18621 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL17P18621 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL17P18621 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL17P18621 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL17P18621 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL17P18621 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL17P18621 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL17P18621 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL17P18621 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL17P18621 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL17P18621 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL17P18621 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL17P18621 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL17P18621 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL17P18621 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL17P18621 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL17P18621 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL17P18621 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL17P18621 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL17P18621 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL17P18621 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL17P18621 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms