Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FLT1P17948 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FLT1P17948 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FLT1P17948 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FLT1P17948 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FLT1P17948 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FLT1P17948 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FLT1P17948 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FLT1P17948 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FLT1P17948 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FLT1P17948 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FLT1P17948 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FLT1P17948 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FLT1P17948 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FLT1P17948 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FLT1P17948 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FLT1P17948 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FLT1P17948 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FLT1P17948 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FLT1P17948 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FLT1P17948 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FLT1P17948 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FLT1P17948 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FLT1P17948 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FLT1P17948 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FLT1P17948 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FLT1P17948 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FLT1P17948 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FLT1P17948 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FLT1P17948 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FLT1P17948 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FLT1P17948 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FLT1P17948 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FLT1P17948 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FLT1P17948 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FLT1P17948 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FLT1P17948 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FLT1P17948 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FLT1P17948 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FLT1P17948 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FLT1P17948 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FLT1P17948 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FLT1P17948 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FLT1P17948 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FLT1P17948 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FLT1P17948 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FLT1P17948 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FLT1P17948 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FLT1P17948 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FLT1P17948 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FLT1P17948 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FLT1P17948 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FLT1P17948 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FLT1P17948 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FLT1P17948 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FLT1P17948 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FLT1P17948 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FLT1P17948 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FLT1P17948 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FLT1P17948 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FLT1P17948 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FLT1P17948 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FLT1P17948 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FLT1P17948 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FLT1P17948 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FLT1P17948 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FLT1P17948 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FLT1P17948 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FLT1P17948 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FLT1P17948 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FLT1P17948 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FLT1P17948 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FLT1P17948 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FLT1P17948 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FLT1P17948 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FLT1P17948 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FLT1P17948 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FLT1P17948 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FLT1P17948 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FLT1P17948 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FLT1P17948 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FLT1P17948 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FLT1P17948 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FLT1P17948 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FLT1P17948 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FLT1P17948 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FLT1P17948 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FLT1P17948 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FLT1P17948 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FLT1P17948 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FLT1P17948 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FLT1P17948 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FLT1P17948 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FLT1P17948 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FLT1P17948 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FLT1P17948 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FLT1P17948 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FLT1P17948 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FLT1P17948 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FLT1P17948 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms