Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms