Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EPCAMP16422 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EPCAMP16422 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EPCAMP16422 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EPCAMP16422 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EPCAMP16422 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EPCAMP16422 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EPCAMP16422 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EPCAMP16422 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EPCAMP16422 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EPCAMP16422 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EPCAMP16422 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
EPCAMP16422 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms