Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms