Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BMP4P12644 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BMP4P12644 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BMP4P12644 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BMP4P12644 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BMP4P12644 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BMP4P12644 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BMP4P12644 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BMP4P12644 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BMP4P12644 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP4P12644 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP4P12644 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP4P12644 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP4P12644 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP4P12644 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP4P12644 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP4P12644 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP4P12644 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP4P12644 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP4P12644 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP4P12644 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP4P12644 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP4P12644 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP4P12644 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP4P12644 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP4P12644 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP4P12644 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP4P12644 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP4P12644 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP4P12644 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP4P12644 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP4P12644 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP4P12644 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP4P12644 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP4P12644 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP4P12644 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP4P12644 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP4P12644 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP4P12644 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP4P12644 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP4P12644 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP4P12644 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP4P12644 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP4P12644 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
BMP4P12644 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
BMP4P12644 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP4P12644 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP4P12644 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP4P12644 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP4P12644 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP4P12644 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP4P12644 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP4P12644 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP4P12644 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP4P12644 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP4P12644 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP4P12644 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP4P12644 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP4P12644 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP4P12644 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP4P12644 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP4P12644 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP4P12644 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP4P12644 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP4P12644 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP4P12644 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP4P12644 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP4P12644 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP4P12644 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP4P12644 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP4P12644 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP4P12644 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP4P12644 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP4P12644 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP4P12644 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP4P12644 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP4P12644 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP4P12644 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP4P12644 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP4P12644 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP4P12644 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP4P12644 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP4P12644 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP4P12644 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP4P12644 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP4P12644 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP4P12644 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP4P12644 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP4P12644 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP4P12644 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP4P12644 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP4P12644 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP4P12644 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP4P12644 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP4P12644 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP4P12644 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP4P12644 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP4P12644 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP4P12644 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP4P12644 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms