Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RLBP1P12271 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms