Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms