Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms