Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
POLA1P09884 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
POLA1P09884 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
POLA1P09884 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
POLA1P09884 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
POLA1P09884 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
POLA1P09884 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
POLA1P09884 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
POLA1P09884 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
POLA1P09884 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
POLA1P09884 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
POLA1P09884 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
POLA1P09884 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
POLA1P09884 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
POLA1P09884 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
POLA1P09884 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
POLA1P09884 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
POLA1P09884 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
POLA1P09884 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
POLA1P09884 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
POLA1P09884 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
POLA1P09884 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
POLA1P09884 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
POLA1P09884 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
POLA1P09884 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
POLA1P09884 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
POLA1P09884 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
POLA1P09884 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
POLA1P09884 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
POLA1P09884 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
POLA1P09884 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
POLA1P09884 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
POLA1P09884 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
POLA1P09884 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
POLA1P09884 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
POLA1P09884 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
POLA1P09884 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
POLA1P09884 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
POLA1P09884 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
POLA1P09884 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
POLA1P09884 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
POLA1P09884 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
POLA1P09884 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
POLA1P09884 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
POLA1P09884 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
POLA1P09884 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
POLA1P09884 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
POLA1P09884 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
POLA1P09884 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
POLA1P09884 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
POLA1P09884 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.02
POLA1P09884 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
POLA1P09884 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
POLA1P09884 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
POLA1P09884 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
POLA1P09884 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
POLA1P09884 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
POLA1P09884 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
POLA1P09884 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
POLA1P09884 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
POLA1P09884 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
POLA1P09884 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
POLA1P09884 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
POLA1P09884 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
POLA1P09884 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
POLA1P09884 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
POLA1P09884 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
POLA1P09884 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
POLA1P09884 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
POLA1P09884 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
POLA1P09884 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
POLA1P09884 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
POLA1P09884 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
POLA1P09884 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
POLA1P09884 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
POLA1P09884 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
POLA1P09884 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
POLA1P09884 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
POLA1P09884 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
POLA1P09884 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
POLA1P09884 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
POLA1P09884 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
POLA1P09884 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
POLA1P09884 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
POLA1P09884 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
POLA1P09884 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
POLA1P09884 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
POLA1P09884 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
POLA1P09884 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
POLA1P09884 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
POLA1P09884 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
POLA1P09884 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
POLA1P09884 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
POLA1P09884 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
POLA1P09884 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
POLA1P09884 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
POLA1P09884 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
POLA1P09884 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
POLA1P09884 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
POLA1P09884 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms