Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEFMP07197 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEFMP07197 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEFMP07197 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEFMP07197 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEFMP07197 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEFMP07197 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEFMP07197 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEFMP07197 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEFMP07197 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEFMP07197 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NEFMP07197 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEFMP07197 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEFMP07197 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NEFMP07197 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NEFMP07197 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NEFMP07197 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NEFMP07197 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NEFMP07197 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NEFMP07197 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NEFMP07197 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NEFMP07197 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEFMP07197 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEFMP07197 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEFMP07197 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEFMP07197 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEFMP07197 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEFMP07197 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEFMP07197 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEFMP07197 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEFMP07197 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEFMP07197 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEFMP07197 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEFMP07197 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEFMP07197 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEFMP07197 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEFMP07197 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEFMP07197 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEFMP07197 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEFMP07197 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEFMP07197 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEFMP07197 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEFMP07197 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEFMP07197 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEFMP07197 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEFMP07197 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEFMP07197 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEFMP07197 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEFMP07197 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEFMP07197 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEFMP07197 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEFMP07197 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEFMP07197 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NEFMP07197 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEFMP07197 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NEFMP07197 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEFMP07197 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NEFMP07197 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEFMP07197 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEFMP07197 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEFMP07197 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEFMP07197 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEFMP07197 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEFMP07197 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEFMP07197 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEFMP07197 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NEFMP07197 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEFMP07197 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEFMP07197 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEFMP07197 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEFMP07197 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEFMP07197 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEFMP07197 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEFMP07197 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEFMP07197 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEFMP07197 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEFMP07197 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEFMP07197 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEFMP07197 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEFMP07197 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEFMP07197 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEFMP07197 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEFMP07197 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEFMP07197 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEFMP07197 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEFMP07197 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEFMP07197 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEFMP07197 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEFMP07197 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEFMP07197 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEFMP07197 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEFMP07197 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEFMP07197 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEFMP07197 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEFMP07197 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEFMP07197 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEFMP07197 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEFMP07197 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEFMP07197 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEFMP07197 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms