Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB3P05106 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB3P05106 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB3P05106 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB3P05106 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB3P05106 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB3P05106 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB3P05106 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB3P05106 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB3P05106 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB3P05106 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB3P05106 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB3P05106 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB3P05106 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB3P05106 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB3P05106 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB3P05106 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB3P05106 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB3P05106 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB3P05106 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB3P05106 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGB3P05106 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGB3P05106 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGB3P05106 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGB3P05106 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGB3P05106 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGB3P05106 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGB3P05106 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGB3P05106 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGB3P05106 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGB3P05106 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGB3P05106 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGB3P05106 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms