Protein–RNA interactions for Protein: P04843

RPN1, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN1P04843 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPN1P04843 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RPN1P04843 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RPN1P04843 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPN1P04843 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPN1P04843 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPN1P04843 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPN1P04843 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPN1P04843 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPN1P04843 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPN1P04843 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPN1P04843 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPN1P04843 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPN1P04843 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPN1P04843 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPN1P04843 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPN1P04843 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPN1P04843 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPN1P04843 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPN1P04843 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPN1P04843 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPN1P04843 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPN1P04843 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPN1P04843 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPN1P04843 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPN1P04843 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPN1P04843 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPN1P04843 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPN1P04843 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPN1P04843 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPN1P04843 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RPN1P04843 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPN1P04843 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPN1P04843 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPN1P04843 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPN1P04843 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPN1P04843 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPN1P04843 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPN1P04843 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPN1P04843 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPN1P04843 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPN1P04843 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPN1P04843 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPN1P04843 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPN1P04843 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPN1P04843 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPN1P04843 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPN1P04843 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPN1P04843 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPN1P04843 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPN1P04843 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPN1P04843 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPN1P04843 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPN1P04843 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPN1P04843 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPN1P04843 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPN1P04843 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPN1P04843 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPN1P04843 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPN1P04843 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPN1P04843 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPN1P04843 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPN1P04843 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPN1P04843 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPN1P04843 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPN1P04843 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPN1P04843 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPN1P04843 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPN1P04843 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPN1P04843 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPN1P04843 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPN1P04843 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPN1P04843 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPN1P04843 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPN1P04843 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPN1P04843 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPN1P04843 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPN1P04843 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPN1P04843 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPN1P04843 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPN1P04843 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPN1P04843 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPN1P04843 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPN1P04843 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPN1P04843 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPN1P04843 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPN1P04843 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPN1P04843 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPN1P04843 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPN1P04843 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPN1P04843 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPN1P04843 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPN1P04843 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPN1P04843 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPN1P04843 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPN1P04843 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPN1P04843 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPN1P04843 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPN1P04843 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPN1P04843 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms