Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EGFRP00533 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EGFRP00533 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EGFRP00533 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EGFRP00533 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EGFRP00533 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EGFRP00533 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EGFRP00533 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EGFRP00533 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EGFRP00533 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EGFRP00533 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EGFRP00533 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EGFRP00533 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EGFRP00533 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EGFRP00533 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EGFRP00533 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EGFRP00533 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EGFRP00533 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EGFRP00533 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EGFRP00533 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EGFRP00533 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EGFRP00533 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EGFRP00533 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EGFRP00533 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EGFRP00533 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EGFRP00533 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EGFRP00533 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EGFRP00533 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EGFRP00533 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EGFRP00533 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EGFRP00533 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EGFRP00533 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EGFRP00533 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EGFRP00533 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EGFRP00533 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EGFRP00533 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EGFRP00533 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EGFRP00533 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EGFRP00533 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EGFRP00533 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EGFRP00533 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EGFRP00533 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EGFRP00533 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EGFRP00533 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EGFRP00533 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EGFRP00533 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EGFRP00533 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EGFRP00533 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EGFRP00533 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EGFRP00533 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EGFRP00533 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EGFRP00533 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EGFRP00533 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EGFRP00533 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EGFRP00533 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EGFRP00533 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EGFRP00533 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EGFRP00533 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EGFRP00533 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EGFRP00533 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EGFRP00533 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EGFRP00533 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EGFRP00533 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EGFRP00533 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EGFRP00533 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EGFRP00533 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EGFRP00533 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EGFRP00533 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EGFRP00533 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EGFRP00533 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EGFRP00533 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EGFRP00533 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EGFRP00533 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EGFRP00533 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EGFRP00533 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EGFRP00533 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EGFRP00533 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EGFRP00533 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EGFRP00533 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EGFRP00533 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EGFRP00533 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EGFRP00533 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EGFRP00533 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EGFRP00533 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EGFRP00533 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EGFRP00533 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EGFRP00533 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EGFRP00533 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EGFRP00533 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EGFRP00533 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EGFRP00533 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EGFRP00533 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EGFRP00533 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EGFRP00533 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EGFRP00533 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EGFRP00533 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EGFRP00533 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EGFRP00533 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EGFRP00533 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EGFRP00533 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms