Protein–RNA interactions for Protein: O95347

SMC2, Structural maintenance of chromosomes protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC2O95347 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC2O95347 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC2O95347 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC2O95347 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC2O95347 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC2O95347 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC2O95347 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC2O95347 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC2O95347 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC2O95347 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC2O95347 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC2O95347 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC2O95347 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC2O95347 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC2O95347 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC2O95347 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC2O95347 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC2O95347 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC2O95347 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC2O95347 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC2O95347 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC2O95347 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC2O95347 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC2O95347 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC2O95347 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC2O95347 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC2O95347 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC2O95347 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC2O95347 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC2O95347 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC2O95347 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC2O95347 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC2O95347 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC2O95347 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC2O95347 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC2O95347 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC2O95347 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC2O95347 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC2O95347 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC2O95347 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC2O95347 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC2O95347 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC2O95347 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC2O95347 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC2O95347 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC2O95347 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC2O95347 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC2O95347 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC2O95347 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC2O95347 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC2O95347 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC2O95347 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC2O95347 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC2O95347 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC2O95347 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC2O95347 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC2O95347 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC2O95347 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC2O95347 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC2O95347 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC2O95347 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC2O95347 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC2O95347 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC2O95347 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC2O95347 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC2O95347 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC2O95347 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC2O95347 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC2O95347 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC2O95347 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC2O95347 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC2O95347 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC2O95347 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC2O95347 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC2O95347 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC2O95347 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC2O95347 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC2O95347 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC2O95347 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC2O95347 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC2O95347 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC2O95347 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC2O95347 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC2O95347 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC2O95347 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC2O95347 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC2O95347 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC2O95347 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC2O95347 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC2O95347 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC2O95347 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC2O95347 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC2O95347 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC2O95347 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC2O95347 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC2O95347 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC2O95347 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC2O95347 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC2O95347 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC2O95347 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms