Protein–RNA interactions for Protein: O95248

SBF1, Myotubularin-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBF1O95248 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SBF1O95248 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SBF1O95248 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SBF1O95248 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SBF1O95248 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SBF1O95248 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SBF1O95248 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SBF1O95248 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SBF1O95248 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SBF1O95248 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SBF1O95248 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SBF1O95248 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SBF1O95248 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SBF1O95248 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SBF1O95248 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SBF1O95248 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SBF1O95248 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SBF1O95248 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SBF1O95248 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SBF1O95248 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SBF1O95248 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SBF1O95248 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SBF1O95248 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SBF1O95248 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SBF1O95248 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SBF1O95248 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SBF1O95248 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SBF1O95248 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SBF1O95248 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SBF1O95248 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SBF1O95248 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SBF1O95248 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SBF1O95248 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SBF1O95248 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SBF1O95248 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SBF1O95248 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SBF1O95248 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SBF1O95248 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SBF1O95248 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SBF1O95248 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SBF1O95248 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SBF1O95248 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SBF1O95248 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SBF1O95248 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SBF1O95248 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SBF1O95248 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SBF1O95248 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SBF1O95248 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SBF1O95248 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SBF1O95248 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SBF1O95248 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SBF1O95248 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SBF1O95248 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SBF1O95248 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SBF1O95248 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SBF1O95248 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SBF1O95248 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SBF1O95248 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SBF1O95248 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SBF1O95248 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SBF1O95248 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBF1O95248 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBF1O95248 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBF1O95248 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBF1O95248 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBF1O95248 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBF1O95248 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBF1O95248 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBF1O95248 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBF1O95248 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBF1O95248 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBF1O95248 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBF1O95248 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBF1O95248 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBF1O95248 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBF1O95248 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBF1O95248 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBF1O95248 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SBF1O95248 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SBF1O95248 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBF1O95248 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBF1O95248 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBF1O95248 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBF1O95248 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBF1O95248 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SBF1O95248 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBF1O95248 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SBF1O95248 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBF1O95248 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBF1O95248 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBF1O95248 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBF1O95248 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SBF1O95248 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SBF1O95248 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SBF1O95248 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SBF1O95248 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SBF1O95248 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SBF1O95248 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SBF1O95248 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SBF1O95248 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms