Protein–RNA interactions for Protein: O95202

LETM1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM1O95202 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LETM1O95202 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LETM1O95202 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LETM1O95202 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LETM1O95202 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LETM1O95202 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LETM1O95202 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LETM1O95202 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LETM1O95202 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LETM1O95202 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LETM1O95202 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LETM1O95202 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LETM1O95202 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LETM1O95202 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LETM1O95202 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LETM1O95202 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LETM1O95202 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LETM1O95202 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LETM1O95202 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LETM1O95202 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LETM1O95202 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LETM1O95202 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LETM1O95202 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LETM1O95202 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LETM1O95202 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LETM1O95202 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LETM1O95202 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LETM1O95202 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LETM1O95202 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LETM1O95202 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LETM1O95202 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LETM1O95202 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LETM1O95202 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LETM1O95202 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LETM1O95202 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LETM1O95202 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LETM1O95202 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LETM1O95202 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LETM1O95202 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LETM1O95202 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LETM1O95202 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LETM1O95202 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LETM1O95202 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LETM1O95202 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LETM1O95202 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LETM1O95202 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LETM1O95202 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LETM1O95202 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
LETM1O95202 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LETM1O95202 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LETM1O95202 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LETM1O95202 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LETM1O95202 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
LETM1O95202 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LETM1O95202 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LETM1O95202 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LETM1O95202 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LETM1O95202 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LETM1O95202 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LETM1O95202 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LETM1O95202 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LETM1O95202 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LETM1O95202 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LETM1O95202 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LETM1O95202 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LETM1O95202 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LETM1O95202 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LETM1O95202 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LETM1O95202 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LETM1O95202 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LETM1O95202 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LETM1O95202 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LETM1O95202 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LETM1O95202 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LETM1O95202 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LETM1O95202 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LETM1O95202 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LETM1O95202 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LETM1O95202 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LETM1O95202 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LETM1O95202 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LETM1O95202 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LETM1O95202 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LETM1O95202 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LETM1O95202 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LETM1O95202 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LETM1O95202 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LETM1O95202 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LETM1O95202 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LETM1O95202 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LETM1O95202 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LETM1O95202 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LETM1O95202 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LETM1O95202 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LETM1O95202 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LETM1O95202 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LETM1O95202 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LETM1O95202 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LETM1O95202 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LETM1O95202 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms