Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BBOX1O75936 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms