Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBNO60934 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBNO60934 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBNO60934 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBNO60934 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBNO60934 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBNO60934 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBNO60934 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBNO60934 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NBNO60934 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NBNO60934 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NBNO60934 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NBNO60934 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBNO60934 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBNO60934 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBNO60934 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBNO60934 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBNO60934 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBNO60934 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBNO60934 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBNO60934 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NBNO60934 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBNO60934 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBNO60934 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NBNO60934 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBNO60934 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBNO60934 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBNO60934 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBNO60934 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NBNO60934 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBNO60934 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBNO60934 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBNO60934 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBNO60934 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBNO60934 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBNO60934 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBNO60934 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBNO60934 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBNO60934 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NBNO60934 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBNO60934 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBNO60934 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBNO60934 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBNO60934 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBNO60934 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBNO60934 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBNO60934 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBNO60934 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NBNO60934 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBNO60934 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBNO60934 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NBNO60934 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBNO60934 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBNO60934 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBNO60934 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBNO60934 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBNO60934 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBNO60934 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBNO60934 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBNO60934 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NBNO60934 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBNO60934 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBNO60934 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBNO60934 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBNO60934 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBNO60934 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NBNO60934 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBNO60934 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBNO60934 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NBNO60934 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBNO60934 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBNO60934 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBNO60934 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBNO60934 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBNO60934 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBNO60934 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBNO60934 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBNO60934 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBNO60934 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBNO60934 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBNO60934 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBNO60934 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBNO60934 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBNO60934 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBNO60934 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBNO60934 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBNO60934 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBNO60934 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBNO60934 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBNO60934 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBNO60934 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBNO60934 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBNO60934 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBNO60934 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBNO60934 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NBNO60934 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NBNO60934 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBNO60934 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NBNO60934 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBNO60934 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms