Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MSCO60682 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MSCO60682 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSCO60682 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSCO60682 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSCO60682 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSCO60682 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSCO60682 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSCO60682 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSCO60682 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSCO60682 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSCO60682 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSCO60682 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSCO60682 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSCO60682 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSCO60682 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSCO60682 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSCO60682 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSCO60682 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSCO60682 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSCO60682 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSCO60682 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSCO60682 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MSCO60682 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSCO60682 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSCO60682 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSCO60682 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSCO60682 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSCO60682 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSCO60682 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSCO60682 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSCO60682 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MSCO60682 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSCO60682 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSCO60682 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSCO60682 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSCO60682 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSCO60682 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSCO60682 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSCO60682 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSCO60682 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSCO60682 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSCO60682 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSCO60682 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSCO60682 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSCO60682 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSCO60682 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSCO60682 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSCO60682 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSCO60682 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSCO60682 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSCO60682 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSCO60682 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSCO60682 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MSCO60682 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSCO60682 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSCO60682 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSCO60682 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MSCO60682 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSCO60682 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSCO60682 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSCO60682 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSCO60682 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSCO60682 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSCO60682 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSCO60682 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSCO60682 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSCO60682 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSCO60682 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSCO60682 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSCO60682 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSCO60682 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSCO60682 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSCO60682 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSCO60682 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSCO60682 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSCO60682 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MSCO60682 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSCO60682 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSCO60682 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MSCO60682 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MSCO60682 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MSCO60682 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MSCO60682 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MSCO60682 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MSCO60682 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSCO60682 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSCO60682 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSCO60682 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSCO60682 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSCO60682 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSCO60682 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSCO60682 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSCO60682 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSCO60682 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MSCO60682 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSCO60682 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSCO60682 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSCO60682 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSCO60682 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms