Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms