Protein–RNA interactions for Protein: O43602

DCX, Neuronal migration protein doublecortin, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCXO43602 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DCXO43602 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCXO43602 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCXO43602 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCXO43602 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCXO43602 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCXO43602 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCXO43602 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCXO43602 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCXO43602 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCXO43602 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCXO43602 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCXO43602 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCXO43602 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCXO43602 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCXO43602 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCXO43602 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCXO43602 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCXO43602 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCXO43602 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCXO43602 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCXO43602 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCXO43602 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCXO43602 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCXO43602 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCXO43602 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCXO43602 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCXO43602 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCXO43602 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCXO43602 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCXO43602 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCXO43602 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCXO43602 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCXO43602 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DCXO43602 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCXO43602 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCXO43602 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCXO43602 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCXO43602 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCXO43602 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCXO43602 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCXO43602 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCXO43602 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCXO43602 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCXO43602 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCXO43602 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCXO43602 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCXO43602 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCXO43602 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCXO43602 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCXO43602 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCXO43602 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCXO43602 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DCXO43602 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DCXO43602 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DCXO43602 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCXO43602 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DCXO43602 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCXO43602 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCXO43602 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCXO43602 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCXO43602 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCXO43602 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DCXO43602 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DCXO43602 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DCXO43602 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
DCXO43602 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCXO43602 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DCXO43602 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DCXO43602 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCXO43602 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCXO43602 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCXO43602 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DCXO43602 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCXO43602 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DCXO43602 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DCXO43602 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCXO43602 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCXO43602 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCXO43602 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DCXO43602 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCXO43602 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCXO43602 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCXO43602 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DCXO43602 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DCXO43602 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCXO43602 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DCXO43602 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCXO43602 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DCXO43602 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCXO43602 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCXO43602 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCXO43602 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCXO43602 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCXO43602 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCXO43602 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCXO43602 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DCXO43602 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCXO43602 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCXO43602 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms