Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms