Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAPO00193 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAPO00193 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAPO00193 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAPO00193 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAPO00193 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAPO00193 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAPO00193 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAPO00193 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAPO00193 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAPO00193 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAPO00193 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAPO00193 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAPO00193 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAPO00193 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAPO00193 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAPO00193 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAPO00193 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAPO00193 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAPO00193 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAPO00193 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAPO00193 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAPO00193 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAPO00193 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAPO00193 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAPO00193 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAPO00193 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAPO00193 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAPO00193 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAPO00193 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAPO00193 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAPO00193 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAPO00193 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAPO00193 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAPO00193 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAPO00193 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAPO00193 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAPO00193 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAPO00193 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAPO00193 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAPO00193 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAPO00193 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAPO00193 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAPO00193 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAPO00193 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAPO00193 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAPO00193 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAPO00193 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAPO00193 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAPO00193 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAPO00193 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAPO00193 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAPO00193 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAPO00193 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAPO00193 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAPO00193 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAPO00193 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAPO00193 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAPO00193 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAPO00193 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAPO00193 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAPO00193 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAPO00193 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAPO00193 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAPO00193 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAPO00193 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAPO00193 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAPO00193 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAPO00193 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAPO00193 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAPO00193 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAPO00193 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAPO00193 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAPO00193 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAPO00193 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAPO00193 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAPO00193 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAPO00193 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAPO00193 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAPO00193 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAPO00193 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAPO00193 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAPO00193 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAPO00193 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAPO00193 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAPO00193 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMAPO00193 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMAPO00193 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMAPO00193 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMAPO00193 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMAPO00193 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAPO00193 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAPO00193 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAPO00193 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAPO00193 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAPO00193 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAPO00193 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAPO00193 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAPO00193 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAPO00193 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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