Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms