Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QKU1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QKU1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QKU1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QKU1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QKU1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QKU1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QKU1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
J3QKU1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
J3QKU1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
J3QKU1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
J3QKU1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
J3QKU1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
J3QKU1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
J3QKU1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
J3QKU1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
J3QKU1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
J3QKU1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
J3QKU1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
J3QKU1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
J3QKU1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
J3QKU1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
J3QKU1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
J3QKU1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
J3QKU1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
J3QKU1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
J3QKU1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
J3QKU1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
J3QKU1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
J3QKU1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
J3QKU1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
J3QKU1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
J3QKU1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
J3QKU1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
J3QKU1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
J3QKU1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
J3QKU1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
J3QKU1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
J3QKU1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
J3QKU1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
J3QKU1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
J3QKU1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
J3QKU1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
J3QKU1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
J3QKU1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
J3QKU1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
J3QKU1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
J3QKU1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
J3QKU1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
J3QKU1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
J3QKU1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
J3QKU1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
J3QKU1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
J3QKU1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
J3QKU1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
J3QKU1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
J3QKU1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
J3QKU1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
J3QKU1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
J3QKU1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
J3QKU1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
J3QKU1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
J3QKU1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
J3QKU1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
J3QKU1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
J3QKU1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
J3QKU1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
J3QKU1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
J3QKU1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
J3QKU1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
J3QKU1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
J3QKU1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
J3QKU1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
J3QKU1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
J3QKU1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
J3QKU1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
J3QKU1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
J3QKU1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
J3QKU1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
J3QKU1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QKU1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QKU1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QKU1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QKU1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QKU1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QKU1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QKU1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QKU1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QKU1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QKU1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QKU1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QKU1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QKU1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QKU1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QKU1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QKU1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QKU1 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QKU1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QKU1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QKU1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms