Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
J3KT08 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
J3KT08 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
J3KT08 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
J3KT08 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
J3KT08 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
J3KT08 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
J3KT08 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
J3KT08 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
J3KT08 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
J3KT08 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
J3KT08 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
J3KT08 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
J3KT08 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
J3KT08 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
J3KT08 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
J3KT08 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
J3KT08 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
J3KT08 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
J3KT08 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
J3KT08 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
J3KT08 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
J3KT08 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
J3KT08 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
J3KT08 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
J3KT08 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
J3KT08 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
J3KT08 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
J3KT08 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
J3KT08 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
J3KT08 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
J3KT08 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
J3KT08 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
J3KT08 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
J3KT08 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
J3KT08 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
J3KT08 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
J3KT08 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
J3KT08 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
J3KT08 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
J3KT08 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
J3KT08 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
J3KT08 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
J3KT08 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
J3KT08 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
J3KT08 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
J3KT08 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
J3KT08 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
J3KT08 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
J3KT08 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
J3KT08 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
J3KT08 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
J3KT08 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
J3KT08 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
J3KT08 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
J3KT08 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
J3KT08 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
J3KT08 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
J3KT08 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
J3KT08 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
J3KT08 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
J3KT08 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
J3KT08 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
J3KT08 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
J3KT08 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
J3KT08 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
J3KT08 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
J3KT08 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
J3KT08 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
J3KT08 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
J3KT08 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
J3KT08 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
J3KT08 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
J3KT08 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
J3KT08 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
J3KT08 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
J3KT08 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
J3KT08 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
J3KT08 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
J3KT08 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
J3KT08 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
J3KT08 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
J3KT08 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
J3KT08 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
J3KT08 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
J3KT08 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
J3KT08 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
J3KT08 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
J3KT08 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
J3KT08 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
J3KT08 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
J3KT08 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
J3KT08 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
J3KT08 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
J3KT08 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
J3KT08 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
J3KT08 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
J3KT08 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
J3KT08 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
J3KT08 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms