Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRRM5B3KS81 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms