Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM1B2RUZ4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms